A Incubadora de Empresas da UFF tem como principal objetivo gerar e estabelecer um tecido empresarial, capaz de interagir com atividades de pesquisa e desenvolvimento da própria Universidade.

A Divisão de Incubadora de Empresas compõe a estrutura da Agência de Inovação da UFF (Agir), órgão responsável por gerir a política de inovação da Universidade. Juntamente com esta divisão há ainda outras três, a saber: Divisão de Articulação Acadêmica; Divisão de Capacitação e Difusão e o Escritório de Transferência do Conhecimento.